Конзерваторско-рестаураторски радови на објекту Али-пашина џамија у Сарајеву се реализују преко Вакуфске дирекције Босне и Херцеговине, а финансирани су из средстава Генералне дирекције вакуфа Републике Турске.

Радове изводи фирма “Фајић” д.о.о. Мостар на основу пројектне документације коју је израдио студио „УРБИНГ“ д.о.о. Сарајево и стручног мишљења Завода за заштиту споменика.

Градитељска цјелина “Алипашина џамија са харемом” у Сарајеву проглашена је националним спомеником Босне и Херцеговине у јануару 2005. године. На национални споменик се примјењују мјере заштите и рехабилитације утврђене Одлуком о проглашењу.

Према пројектној документацији радови обухватају санацију свих вањских зидних површина укључујући тријем и мунару, унутрашње зидне површине, мобилијар (михраб, махфил и мимбер) те радове у харему џамије турбе, чесме и нишане.

Тренутно се изводе радови на уклањању кречних премаза до најстаријег слоја на свим унутрашњим зидовима (равне зидне површине, купола, лукови, пандатифи), мобилијару (михраб, махфил, и мимбер) те на обијање постојећих фуга на вањским зидовима. Слиједе радови на санацији оштећења на куполи и зидовима и то запуњавањем пукотина, ињектирањем и аплицирањем карбонског платна и ламеле.

Закључено је да се радови изводе у складу са пројектном документацијом, принципима и стандардима заштите објеката културно-хисторијског насљеђа те у складу са утврђеном динамиком радова.